8/11/2019 Latihan Soal 1 Biokimia
1/13
Nama : Agita Dzulhajh Anggraini
NIM : 130331811074
LATIHAN SOAL PENDAHULUAN BIOKIMIA
1.
Definisikan istilah-istilah berikut, dengan contohnya masing-masing:
a. Biokimia
Biokimia adalah ilmu pengetahuan tentang dasar kimiawi kehidupan. Atau dengan kata
lain, biokimia adalah ilmu pengetahuan tentang konstituen kimiawi sel hidup serta
reaksi dan proses yang dialami konstituen tersebut. Contoh: mempelajari struktur
protein, mempelajari metabolisme karbohidrat.
b. Reaksi biokimia
Reaksi biokimia adalah reaksi yang dikendalikan oleh enzim dan berlangsung baik di
dalam maupun di luar tubuh organisme. Contoh: metabolisme sel di dalam tubuh, reaksi
fermentasi tape
c. Organisme seluler
Organisme seluler adalah makhluk hidup yang terdiri dari sel, baik uniseluler (sel
tunggal) maupun multiseluler (banyak sel). Contoh: organisme uniseluler adalah
amoeba, beberapa jenis Protista dan Cyanobacteria; organisme multiseluler adalah
hewan dan tumbuhan.
d. Biomolekul
Biomolekul adalah senyawa-senyawaorganikpembentuk organisme hidup dan bersifat
khas sebagai produk aktivitas biologis. Contoh: karbohidrat, lipid, protein, asam nukleat
e. Metabolisme
Metabolisme adalah semuareaksi kimia yang melibatkan sejumlahsubstrat yangbereaksi dengan dikatalisisenzim dan terjadi di dalamorganisme,termasuk yang
terjadi di tingkatselular.Contoh: katabolisme dan anabolisme
2.
Apakah bedanya, antara:
a. Benda hidup dan benda mati menurut biokimia
No Benda hidup Benda mati
1 Mempunyai susunan yang kompleks
tetapi terorganisir dengan sangat rapi.
Tidak mempunyai susunan yang
kompleks tetapi terorganisir dengan
http://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Organik&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Organik&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Organik&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/wiki/Reaksi_kimiahttp://id.wikipedia.org/wiki/Substrathttp://id.wikipedia.org/wiki/Enzimhttp://id.wikipedia.org/wiki/Organismehttp://id.wikipedia.org/wiki/Sel_%28biologi%29http://id.wikipedia.org/wiki/Sel_%28biologi%29http://id.wikipedia.org/wiki/Organismehttp://id.wikipedia.org/wiki/Enzimhttp://id.wikipedia.org/wiki/Substrathttp://id.wikipedia.org/wiki/Reaksi_kimiahttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Organik&action=edit&redlink=18/11/2019 Latihan Soal 1 Biokimia
2/13
sangat rapi.
2 Mampu mempertahankan keteraturan
dirinya di dalam lingkungan yang
semakin tidak teratur.
Tidak mampu mempertahankan
keteraturan dirinya di dalam
lingkungan yang semakin tidak
teratur.3 Dapat mereplikasi diri (berkembang
biak).
Tidak dapat mereplikasi diri
(berkembang biak).
b.
Sel prokariot dan sel eukariot
Karakteristik Prokariotik Eukariotik
Ukuran sel (diameter) 0,1-5 m 10-100 m
Organel sel Tidak ada organel sel Terdapat organel sel seperti
lisosom, retikulum
endoplasma,
sentriol,lisosom,badan golgi,
dan mitokondria
Inti sel Tidak memiliki inti yang
sebenarnya, materi inti
tersebar dalam sitoplasma
karena tidak mempunyai
membran inti
Memiliki nukleus yang
sebenarnya karena materi inti
dilingkupi oleh membrane inti
Dinding sel Dinding selnya
mengandung
peptidoglikan.
Tidak semua sel eukariotik
memilikidinding sel.
Transkripsi Proses transkipsi terjadilebih sederhana Transkipsi lebih rumit terjadi,dikarenakan akses RNA
polymerase terhadap DNA
lebih lama akibat DNA
dikemas secara kompak
dengan protein histon
Jumlah kromosom Hanya memiliki
kromosom tunggal
Memiliki kromosom lebih dari
1 (satu)
Tempat pembuangan Vakuola sebagai tempat
pembuangan
Pembuangan langsung ke luar
sel
c.
Organ dan organel
Organ Organel
Merupakan kelompokjaringan yang
melakukan beberapafungsi.
Contoh:jantung,paru-paru,otak,mata,
lambung,limpa,pankreas,ginjal,hati,
usus,kulit,uterus,saluran urin,dan
tulang.
Merupaka salah satu dari beberapa
struktur dengan fungsi khusus yang
terapung-apung dalamsitoplasmasel
eukariot.
Contoh: kloroplas, mitokondria,
retikulum endoplasma, lisosom,
nukleus, ribosom, badan golgi, dll.
http://hedisasrawan.blogspot.com/2013/10/lisosom-artikel-lengkap.htmlhttp://hedisasrawan.blogspot.com/2013/10/badan-golgi-artikel-lengkap.htmlhttp://hedisasrawan.blogspot.com/2013/10/dinding-sel-artikel-lengkap.htmlhttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Jaringan_biologi&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Fungsionalitas&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/wiki/Jantunghttp://id.wikipedia.org/wiki/Paru-paruhttp://id.wikipedia.org/wiki/Otakhttp://id.wikipedia.org/wiki/Matahttp://id.wikipedia.org/wiki/Lambunghttp://id.wikipedia.org/wiki/Limpahttp://id.wikipedia.org/wiki/Pankreashttp://id.wikipedia.org/wiki/Ginjalhttp://id.wikipedia.org/wiki/Hatihttp://id.wikipedia.org/wiki/Usushttp://id.wikipedia.org/wiki/Kulithttp://id.wikipedia.org/wiki/Uterushttp://id.wikipedia.org/wiki/Saluran_urinhttp://id.wikipedia.org/wiki/Tulanghttp://id.wikipedia.org/wiki/Sitoplasmahttp://id.wikipedia.org/wiki/Selhttp://id.wikipedia.org/wiki/Eukariothttp://id.wikipedia.org/wiki/Eukariothttp://id.wikipedia.org/wiki/Selhttp://id.wikipedia.org/wiki/Sitoplasmahttp://id.wikipedia.org/wiki/Tulanghttp://id.wikipedia.org/wiki/Saluran_urinhttp://id.wikipedia.org/wiki/Uterushttp://id.wikipedia.org/wiki/Kulithttp://id.wikipedia.org/wiki/Usushttp://id.wikipedia.org/wiki/Hatihttp://id.wikipedia.org/wiki/Ginjalhttp://id.wikipedia.org/wiki/Pankreashttp://id.wikipedia.org/wiki/Limpahttp://id.wikipedia.org/wiki/Lambunghttp://id.wikipedia.org/wiki/Matahttp://id.wikipedia.org/wiki/Otakhttp://id.wikipedia.org/wiki/Paru-paruhttp://id.wikipedia.org/wiki/Jantunghttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Fungsionalitas&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Jaringan_biologi&action=edit&redlink=1http://hedisasrawan.blogspot.com/2013/10/dinding-sel-artikel-lengkap.htmlhttp://hedisasrawan.blogspot.com/2013/10/badan-golgi-artikel-lengkap.htmlhttp://hedisasrawan.blogspot.com/2013/10/lisosom-artikel-lengkap.html8/11/2019 Latihan Soal 1 Biokimia
3/13
d. Katabolisme dan anabolisme
Katabolisme Anabolisme
Adalah reaksi penguraianmolekul
senyawa organik untuk mendapatkan
energi (molekul kompleks menjadi
senyawa sederhana).
Contoh: respiasi sel (menghasilkan
energi dari karbohidrat, protein, dan
lemak), respirasi aerobik, dan respirasi
anaerobik
Adalah reaksi yang merangkai senyawa
organik dari molekul-molekul tertentu,
untuk diserap oleh seltubuh.
Contoh: glikogenesis (pembentukan
glikogen dari glukosa), glukoneogenesis
(pembentukan glukosa dari senyawa
organik lain), fotosintesis.
e. Sel hewan dan sel tumbuhan
Sel hewan Sel tumbuhan
Tidak memiliki dinding sel.
Tidak memiliki kloroplas.
Memiliki vakuola yang lebih kecil.
Memiliki sentriol.
Dinding sel tersusun atas selulosa dan
protein.
Memiliki plastida, terutama kloroplas
yang mengandung klorofil (pigmen
warna hijau) berfungsi untuk
fotosintesis.
Memiliki vakuola yang besar.
Tidak memiliki sentriol.
f.
Mikroskop cahaya dan mikroskop electron
Mikroskop cahaya Mikroskop elektron
Mikroskop cahaya mempunyai
perbesaran maksimum 1000 kali.
Mikroskop elektron mempunyai
perbesaran sampai lebih dari satu juta
kali.
Menggunakan cahaya tampak sebagai
sumber pencahayaan
Menggunakan sinar katoda sebagai
sumber pencahayaan
3. Jelaskan:
a.
Mengapa Virus bisa dimasukkan sebagai benda hidup ,tetapi juga benda mati ?
Virus dimasukkan sebagai benda hidup karena di dalam sel makhluk hidup (sel inang)
dapat menjalankan fungsi biologisnya secara bebas dan dapat bereplikasi. Sedangkan
virus dapat dimasukkan sebagai benda mati karena jika diluar sel makhluk hidup (sel
inang) tidak dapat menjalankan fungsi biologisnya dan tidak dapat bereplikasi, serta
dapat dikristalkan.
http://id.wikipedia.org/wiki/Molekulhttp://id.wikipedia.org/wiki/Senyawa_organikhttp://id.wikipedia.org/wiki/Energihttp://id.wikipedia.org/wiki/Tubuhhttp://web.ipb.ac.id/~tpb/files/materi/bio100/Gambar/mikroskop/mikroskop_chy.jpghttp://web.ipb.ac.id/~tpb/files/materi/bio100/Gambar/mikroskop/mikroskop_chy.jpghttp://id.wikipedia.org/wiki/Tubuhhttp://id.wikipedia.org/wiki/Energihttp://id.wikipedia.org/wiki/Senyawa_organikhttp://id.wikipedia.org/wiki/Molekul8/11/2019 Latihan Soal 1 Biokimia
4/13
b. Bilamana kita harus menggunakan mikroskop cahaya, mikroskop electron atau difraksi
sinar X?
Mikroskop cahaya Mikroskop elektron Difraksi sinar X
Digunakan dengan cahayalampu untuk meneliti
obyek dengan ukuran yang
lebih besar.
Digunakan denganelektromagnetik untuk
meneliti ultrastruktur dari
berbagai spesimen biologi
dan anorganik termasuk
mikroorganisme, sel, dll
dan obyek pengamatan
harus setipis mungkin.
Digunakan untukmempelajari keteraturan
atom atau molekul dalam
suatu struktur tertentu dan
dapat memberikan informasi
tentang struktur polimer,
termasuk tentang keadaan
amorf dan kristalin polimer.
c. Perbedaan antara keempat biomolekul berikut, dalam hal struktur, fungsi dan
keberadaan/kelimpahannya di dalam sel/ organisme?
Biomolekul
Perbedaan
Struktur FungsiKelimpahan dalam
sel/organisme
Karbohidrat Terdiri ataskarbon,hidrogen,dan
oksigen.
Mengandunggugus fungsikarbonil(sebagaialdehida atauketon)dan
banyak gugushidroksil.
Struktur molekul:
(a)
Monosakarida (satu molekulgula), misalnya glukosa.
(b)Disakarida (dua molekul
monosakarida), misalnya sukrosa.
(c)
Polisakarida (banyak molekul
monosakarida), misalnya
selulosa.
Sumber
energi.
Cadanganenergi.
Pembentuk
struktur.
Dalam darah
sebagai glukosa
untuk keperluan
energi.
Dalam hati danjaringan otot
sebagai glikogen.
Protein Polimer dari asam amino.
Masing-masing protein memiliki
Pembentuk
struktur.
Molekul organik
terbanyak di dalam
http://id.wikipedia.org/wiki/Karbonhttp://id.wikipedia.org/wiki/Hidrogenhttp://id.wikipedia.org/wiki/Oksigenhttp://id.wikipedia.org/wiki/Gugus_fungsihttp://id.wikipedia.org/wiki/Karbonilhttp://id.wikipedia.org/wiki/Aldehidahttp://id.wikipedia.org/wiki/Ketonhttp://id.wikipedia.org/wiki/Hidroksilhttp://id.wikipedia.org/wiki/Monosakaridahttp://id.wikipedia.org/wiki/Monosakaridahttp://id.wikipedia.org/wiki/Polisakaridahttp://id.wikipedia.org/wiki/Polisakaridahttp://id.wikipedia.org/wiki/Polisakaridahttp://id.wikipedia.org/wiki/Monosakaridahttp://id.wikipedia.org/wiki/Hidroksilhttp://id.wikipedia.org/wiki/Ketonhttp://id.wikipedia.org/wiki/Aldehidahttp://id.wikipedia.org/wiki/Karbonilhttp://id.wikipedia.org/wiki/Gugus_fungsihttp://id.wikipedia.org/wiki/Oksigenhttp://id.wikipedia.org/wiki/Hidrogenhttp://id.wikipedia.org/wiki/Karbon8/11/2019 Latihan Soal 1 Biokimia
5/13
jumlah dan urutan asam amino
yang khas.
(a)Struktur primer: urutan linier
asam amino dalam satu rantaipolipeptida yang dihubungkan
melaluiikatan peptida (amida).
(b)
Struktur sekunder: rangkaian
asam amino pada protein yang
distabilkan olehikatan hidrogen.
(c)Struktur tersier: pelipatan struktur
sekunder bersama-sama dengan
penempatan ruang gugus R-nya
membentuk struktur tiga-dimensi
(gabungan dari aneka ragam
struktur sekunder), biasanyaberupa gumpalan. Struktur tersier
distabilkan oleh beberapa
interaksi lemah (interaksi
hidrofobik, elektrostatik, ikatan
hidrogen, dan ikatan van der
waals).
(d)Struktur kuarterner: pengaturan
ruang beberapa struktur tersier
yang terjadi pada protein
multimerik (protein yang terdiri
lebih dari satu rantai polipeptida).
Biokatalis/enzim.
sel yang berada di
dalam gen.
Lipid Mampu membentuk struktursepertivesikel,liposom,atau
membran lain dalam lingkungan
basah.
Tersusun atas gliserol dan asam
lemak
Penyusunmembran
sel.
Penahanpanas dan
benturan.
Cadanganenergi.
5-25% berat tubuh
mamalia adalah
lipid dan 90%
berupa asil gliserol
atau trigliserida.
Pada sel, lipid
terdapat dalam
sitosol.
Asam
nukleat
Tersusun atas rantainukleotida
(sebuahbasa nitrogenheterosiklikyaitupurin ataupirimidin,sebuah
gulapentosa,dan sebuah gugus
fosfat)yang mengandunginformasi
genetik yaituAsam
deoksiribonukleat (DNA)dan
Asam ribonukleat (RNA).
Penyimpan
an danpembawa
informasi
genetik.
Penyusunribosom.
Dalam nukleus/inti
sel.
http://id.wikipedia.org/wiki/Ikatan_peptidahttp://id.wikipedia.org/wiki/Amidahttp://id.wikipedia.org/wiki/Ikatan_hidrogenhttp://id.wikipedia.org/wiki/Vesikelhttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Liposom&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/wiki/Nukleotidahttp://id.wikipedia.org/wiki/Basahttp://id.wikipedia.org/wiki/Heterosiklikhttp://id.wikipedia.org/wiki/Purinhttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Pirimidin&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/wiki/Gulahttp://id.wikipedia.org/wiki/Pentosahttp://id.wikipedia.org/wiki/Fosfathttp://id.wikipedia.org/wiki/Informasi_genetikhttp://id.wikipedia.org/wiki/Informasi_genetikhttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_deoksiribonukleathttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_deoksiribonukleathttp://id.wikipedia.org/wiki/DNAhttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_ribonukleathttp://id.wikipedia.org/wiki/RNAhttp://id.wikipedia.org/wiki/RNAhttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_ribonukleathttp://id.wikipedia.org/wiki/DNAhttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_deoksiribonukleathttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_deoksiribonukleathttp://id.wikipedia.org/wiki/Informasi_genetikhttp://id.wikipedia.org/wiki/Informasi_genetikhttp://id.wikipedia.org/wiki/Fosfathttp://id.wikipedia.org/wiki/Pentosahttp://id.wikipedia.org/wiki/Gulahttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Pirimidin&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/wiki/Purinhttp://id.wikipedia.org/wiki/Heterosiklikhttp://id.wikipedia.org/wiki/Basahttp://id.wikipedia.org/wiki/Nukleotidahttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Liposom&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/wiki/Vesikelhttp://id.wikipedia.org/wiki/Ikatan_hidrogenhttp://id.wikipedia.org/wiki/Amidahttp://id.wikipedia.org/wiki/Ikatan_peptida8/11/2019 Latihan Soal 1 Biokimia
6/13
4. Tiga macam cara klasifikasi makhluk hidup, dasar klasifikasi dan contoh hasil klasifikasi
masing-masing, bagi :manusia , E.coli, virus dan tanaman.
Organisme
Cara Klasifikasi
Jenis sel Sumber energi dansumber karbon
Kekerabatan genetik
Manusia Seluler eukariot Kemotrof organotrof Eukaria
E.coli Seluler prokariot Kemotrof organotrof Eukaria
Virus Aseluler Parasit obligat -
Tanaman Seluler eukariot Fototrof autotrof Eukaria
8/11/2019 Latihan Soal 1 Biokimia
7/13
LATIHAN SOAL STRUKTUR FUNGSI PROTEIN
1.
Jelaskan pengertian dari istilah-istilah berikut, jika perlu dengan contohnya:
a.
Biomolekul
Biomolekul adalah senyawa-senyawaorganikpembentuk organisme hidup dan bersifat
khas sebagai produk aktivitas biologis. Contoh: karbohidrat, lipid, protein, asam nukleat
b. Monomer
Monomer adalah molekul sederhana dan kecil yang menjadi penyusun molekul dan
senyawa yang lebih besar dan kompleks. Contoh:hidrokarbon,gula,asam amino,
atauasam lemak.
c.
Polimer
Polimer adalah molekul raksasa (makromolekul) yang merupakan gabungan dari
monomermonomer. Contoh: plastik dan DNA
d. Protein konyugasi
Protein konyugasi adalah protein sederhana yang terikat dengan bahan-bahan non-asam
amino. Bagian yang bukan asam amino dari protein konjugasi disebut gugus prostetik.
Contoh: glikoprotein, lipoprotein, hemoprotein, fosfoprotein, dan metaloprotein.
e.
Denaturasi protein
Denaturasi protein adalahkondisi di mana struktur sekunder, tersier maupun kuartener
dari suatu protein mengalami modifikasi tanpa ada pemecahan ikatan peptida. Faktor
yang mempengaruhi denaturasi protein adalah disebabkan perubahan suhu, perubahan
pH yang ekstrim oleh beberapa zat pelarut seperti alkohol atau aseton, beberapa zat
terlarut seperti urea, zat organik, lalu oleh detergen, logam berat, ataupun oleh
pengguncangan yang intensif. Contoh: denaturasi protein putih telur
f.
EnzimEnzim adalahbiomolekulberupaprotein yang berfungsi sebagaikatalis (senyawa yang
mempercepat proses reaksi tanpa habis bereaksi) dalam suatureaksi kimiaorganik.
Contoh:laktase,merupakan enzim yang mengurailaktosa
g.
Enzim hidrolase
Enzim hidrolase adalah enzim yang bekerja untuk mengontrol atau mengkatalisis proses
hidrolisis dalam tubuh. Contoh: Amilase yang berperan menghidrolisis pati menjadi
glukosa
http://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Organik&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Organik&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Organik&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/wiki/Hidrokarbonhttp://id.wikipedia.org/wiki/Gulahttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_aminohttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_lemakhttp://id.wikipedia.org/wiki/Biomolekulhttp://id.wikipedia.org/wiki/Proteinhttp://id.wikipedia.org/wiki/Katalishttp://id.wikipedia.org/wiki/Reaksi_kimiahttp://id.wikipedia.org/wiki/Senyawa_organikhttp://id.wikipedia.org/wiki/Laktasehttp://id.wikipedia.org/wiki/Laktosahttp://id.wikipedia.org/wiki/Laktosahttp://id.wikipedia.org/wiki/Laktasehttp://id.wikipedia.org/wiki/Senyawa_organikhttp://id.wikipedia.org/wiki/Reaksi_kimiahttp://id.wikipedia.org/wiki/Katalishttp://id.wikipedia.org/wiki/Proteinhttp://id.wikipedia.org/wiki/Biomolekulhttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_lemakhttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_aminohttp://id.wikipedia.org/wiki/Gulahttp://id.wikipedia.org/wiki/Hidrokarbonhttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Organik&action=edit&redlink=18/11/2019 Latihan Soal 1 Biokimia
8/13
h. Ikatan peptida
Ikatan peptida adalah ikatan yang terjadi antara dua molekul asam amino yang dapat
diikat secara kovalen melalui suatu ikatan amida substitusi.
Contoh: bagian yang diarsir adalah ikatan peptida
2. Sebutkan 4 macam biomolekul yang penting, bandingkan struktur dan fungsinya masing-
masing!
BiomolekulPerbedaan
Struktur Fungsi
Karbohidrat Terdiri ataskarbon,hidrogen,dan
oksigen.
Mengandunggugus fungsikarbonil
(sebagaialdehida atauketon)dan
banyak gugushidroksil.Struktur molekul:
(d)Monosakarida (satu molekul gula),
misalnya glukosa.
(e)Disakarida (dua molekul
monosakarida), misalnya sukrosa.
(f)Polisakarida (banyak molekul
monosakarida), misalnya selulosa.
Sumber energi.
Cadangan energi.
Pembentuk struktur.
Protein
Polimer dari asam amino.
Pembentuk struktur.
http://id.wikipedia.org/wiki/Karbonhttp://id.wikipedia.org/wiki/Hidrogenhttp://id.wikipedia.org/wiki/Oksigenhttp://id.wikipedia.org/wiki/Gugus_fungsihttp://id.wikipedia.org/wiki/Karbonilhttp://id.wikipedia.org/wiki/Aldehidahttp://id.wikipedia.org/wiki/Ketonhttp://id.wikipedia.org/wiki/Hidroksilhttp://id.wikipedia.org/wiki/Monosakaridahttp://id.wikipedia.org/wiki/Monosakaridahttp://id.wikipedia.org/wiki/Polisakaridahttp://id.wikipedia.org/wiki/Polisakaridahttp://id.wikipedia.org/wiki/Polisakaridahttp://id.wikipedia.org/wiki/Monosakaridahttp://id.wikipedia.org/wiki/Hidroksilhttp://id.wikipedia.org/wiki/Ketonhttp://id.wikipedia.org/wiki/Aldehidahttp://id.wikipedia.org/wiki/Karbonilhttp://id.wikipedia.org/wiki/Gugus_fungsihttp://id.wikipedia.org/wiki/Oksigenhttp://id.wikipedia.org/wiki/Hidrogenhttp://id.wikipedia.org/wiki/Karbon8/11/2019 Latihan Soal 1 Biokimia
9/13
Masing-masing protein memilikijumlah dan urutan asam amino yang
khas.
(e)
Struktur primer: urutan linier asamamino dalam satu rantai
polipeptida yang dihubungkan
melaluiikatan peptida (amida).
(f)Struktur sekunder: rangkaian asam
amino pada protein yang
distabilkan olehikatan hidrogen.
(g)Struktur tersier: pelipatan struktur
sekunder bersama-sama dengan
penempatan ruang gugus R-nya
membentuk struktur tiga-dimensi
(gabungan dari aneka ragamstruktur sekunder), biasanya berupa
gumpalan. Struktur tersier
distabilkan oleh beberapa interaksi
lemah (interaksi hidrofobik,
elektrostatik, ikatan hidrogen, dan
ikatan van der waals).
(h)Struktur kuarterner: pengaturan
ruang beberapa struktur tersier
yang terjadi pada protein
multimerik (protein yang terdiri
lebih dari satu rantai polipeptida).
Biokatalis/enzim.
Lipid Mampu membentuk struktur seperti
vesikel,liposom,atau membran lain
dalam lingkungan basah.
Tersusun atas gliserol dan asam
lemak
Penyusun membran sel.
Penahan panas danbenturan.
Cadangan energi.
Asam
nukleatTersusun atas rantainukleotida
(sebuahbasa nitrogenheterosiklik
yaitupurin ataupirimidin,sebuah
gulapentosa,dan sebuah gugus
fosfat)yang mengandunginformasigenetik yaituAsam
deoksiribonukleat (DNA)danAsam
ribonukleat (RNA).
Penyimpanan dan pembawa
informasi genetik.
Penyusun ribosom.
http://id.wikipedia.org/wiki/Ikatan_peptidahttp://id.wikipedia.org/wiki/Amidahttp://id.wikipedia.org/wiki/Ikatan_hidrogenhttp://id.wikipedia.org/wiki/Vesikelhttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Liposom&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/wiki/Nukleotidahttp://id.wikipedia.org/wiki/Basahttp://id.wikipedia.org/wiki/Heterosiklikhttp://id.wikipedia.org/wiki/Purinhttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Pirimidin&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/wiki/Gulahttp://id.wikipedia.org/wiki/Pentosahttp://id.wikipedia.org/wiki/Fosfathttp://id.wikipedia.org/wiki/Informasi_genetikhttp://id.wikipedia.org/wiki/Informasi_genetikhttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_deoksiribonukleathttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_deoksiribonukleathttp://id.wikipedia.org/wiki/DNAhttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_ribonukleathttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_ribonukleathttp://id.wikipedia.org/wiki/RNAhttp://id.wikipedia.org/wiki/RNAhttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_ribonukleathttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_ribonukleathttp://id.wikipedia.org/wiki/DNAhttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_deoksiribonukleathttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_deoksiribonukleathttp://id.wikipedia.org/wiki/Informasi_genetikhttp://id.wikipedia.org/wiki/Informasi_genetikhttp://id.wikipedia.org/wiki/Fosfathttp://id.wikipedia.org/wiki/Pentosahttp://id.wikipedia.org/wiki/Gulahttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Pirimidin&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/wiki/Purinhttp://id.wikipedia.org/wiki/Heterosiklikhttp://id.wikipedia.org/wiki/Basahttp://id.wikipedia.org/wiki/Nukleotidahttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Liposom&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/wiki/Vesikelhttp://id.wikipedia.org/wiki/Ikatan_hidrogenhttp://id.wikipedia.org/wiki/Amidahttp://id.wikipedia.org/wiki/Ikatan_peptida8/11/2019 Latihan Soal 1 Biokimia
10/13
3. Berikan nama dan strukur asam amino yang:
a. Polar dan bersifat Asam
Asam Glutamat Asam Aspartat
b.
Polar dan bersifat Basa
Lisin Arginin
c.
Polar dan Netral
Glutamin Sistein Serin
Asparagin Troenin
8/11/2019 Latihan Soal 1 Biokimia
11/13
d. Non Polar dan mengandung Cincin Aromatis
Fenilalanin Tirosin Triptofan
4.
Apa bedanya:
a.
Asam amino dan protein
Asam amino merupakan golongan senyawa hidrokarbon yang mengandung gugus
karboksil (-COOH) dan satu gugus amina (-NH2).
Protein adalah makromolekul yang tersusun dari rantai-rantai panjang asam amino yang
saling berikatan melalui ikatan peptida.
b. Protein serat dan protein globular
Protein serat bersifat tidak larut di dalam air, merupakan molekul serabut panjang,
dengan rantai polipeptida yang memanjang pada satu sumbu, dan tidak berlipat menjadi
bentuk globular. Hampir semua protein serabut memberikan peranan struktural dan
pelindung.
Pada protein globular merupakan rantai-rantai polipeptida berlipat rapat-rapat menjadi
bentuk globular atau bulat padat. Protein globular biasanya larut di dalam sistem larutan
(air) dan segera berdifusi; hampir semua mempunyai fungsi gerak dinamik.
c. Struktur primer dan struktur tersier suatu protein
Struktur primer: Urutan linear asam amino yang disatukan oleh ikatan peptida
Struktur tersier: Pelipatan struktur sekunder bersama-sama dengan penempatan ruang
gugus R-nya membentuk struktur tiga-dimensi (gabungan dari aneka ragam struktur
sekunder), biasanya berupa gumpalan. Struktur tersier distabilkan oleh beberapa
interaksi lemah (interaksi hidrofobik, elektrostatik, ikatan hidrogen, dan ikatan van der
waals).
8/11/2019 Latihan Soal 1 Biokimia
12/13
d. Struktur tersier dan kuartener suatu protein
Struktur tersier: Pelipatan struktur sekunder bersama-sama dengan penempatan ruang
gugus R-nya membentuk struktur tiga-dimensi (gabungan dari aneka ragam struktur
sekunder), biasanya berupa gumpalan. Struktur tersier distabilkan oleh beberapa
interaksi lemah (interaksi hidrofobik, elektrostatik, ikatan hidrogen, dan ikatan van der
waals).
Struktur kuartener: Beberapa protein tersusun atas lebih dari satu rantai polipeptida.
Struktur kuartener menggambarkan subunit-subunit yang berbeda dipak bersama-sama
membentuk struktur protein.
e. Ujung N dan ujung C protein
Ujung N merupakan residu asam amino pada ujung suatu peptida yang mempunyai
gugus -amino.
Ujung C merupakan residu pada pada ujung suatu peptida yang mempunyai gugus
karboksil bebas.
5. Sebutkan minimal 4 macam fungsi protein di dalam tubuh dengan contoh jenis proteinnya!
No Protein Fungsi Contoh
1 Enzim Katalisator biologis Enzim selulosa,
enzim amilase
2 Protein transport Pergerakkan senyawa antar atau intra sel Hemoglobin
3 Pertahanan
(antibodi)
Mempertahankan serta melindungi diri Imunoglobin,
fibrinogen, trombin
4 Struktur Proteksi, penyangga, pergerakan Kolagen, keratin,
fibroin
6.
Jelaskan:
a. Apa yang membedakan suatu jenis protein dari jenis protein lainnya?
Protein dapat dibedakan berdasarkan strukturnya, fungsinya, bentuknya maupun
komposisinya.
b. Apa yang menyebabkan denaturasi protein? Apa hubungannya dengan penggunaan
alkohol sebagai antiseptik?
Denaturasi protein adalahkondisi di mana struktur sekunder, tersier maupun kuartener
dari suatu protein mengalami modifikasi tanpa ada pemecahan ikatan peptida.
Denaturasi protein disebabkan perubahan suhu, perubahan pH yang ekstrim oleh
8/11/2019 Latihan Soal 1 Biokimia
13/13
beberapa zat pelarut seperti alkohol atau aseton, beberapa zat terlarut seperti urea, zat
organik, lalu oleh detergen, logam berat, ataupun oleh pengguncangan yang intensif.
Dlam hal ini, alkohol merupakan salah satu senyawa organik yang dapat mendenaturasi
protein mikroorganisme dengan cara memutuskan ikatan hidrogen intramolekul pada
rantai samping protein. Ikatan hidrogen yang baru dapat terbentuk antara alkohol dan
rantai samping protein tersebut sehingga merusak struktur protein penyususn
mikroorganisme tersbut dan menyebabkan mikroorganisme tersebut kehilangan fungsi
biologisnya. Oleh karena itu alkohol digunakan sebagai antiseptis.
c.
Apa artinya pI dan dapat digunakan untuk apa?
pI merupakan pH dimana suatu asam amino bermuatan netral atau suatu nilai pH
dimana protein memiliki jumlah muatan negatif yang sama dengan jumlah muatan
positifnya. Harga pI suatu asam amino memberikan pengaruh penting pada sifat
biokimia asam amino tersebut yang dapat dimanfaatkan pada proses pemurnian dan
elektroforesis. Pada elektroforesis, jika pH larutan penyangga (buffer) lebih besar
daripada titik isoelektriknya, maka molekul protein akan bermigrasi menuju kutub
positif. Sementara jika pH buffer lebih rendah daripada titik isoelektriknya, maka
molekul protein akan bermigrasi menuju kutub negatif. Dan jika pH buffer sama dengan
titik isoelektrik, maka protein akan diam di tempat atau tidak bermigrasi sama sekali.