KERAGAMAN LOKUS HEMOGLOBIN ( Hb) PADA AYAM …eprints.unram.ac.id/6833/1/JOURNAL.pdfAyam kampung (Gallus domesticus) adalah salah satu jenis ternak unggas yang merupakan turunan panjang

1

KERAGAMAN LOKUS HEMOGLOBIN ( Hb)

PADA AYAM KAMPUNG KULIT KUNING

HASIL PERSILANGAN MENGGUNAKAN PEJANTAN

DARI LOMBOK TIMUR

PUBLIKASI ILMIAH

Untuk Memenuhi Persyaratan

Memperoleh Gelar Sarjana

Program Studi Peternakan

Oleh:

AHSANUL FAIZIN

B1D 010 031

FAKULTAS PETERNAKAN

UNIVERSITAS MATARAM

MATARAM

2016

2




DARI LOMBOK TIMUR

PUBLIKASI ILMIAH

Diserahkan Guna Memenuhi Sebagian Syarat yang Diperlukan

untuk Mendapat Drajat Sarjana Peternakan

pada Program Studi Peternakan

Oleh

AHSANULFAIZIN

B1D 010 031

Menyetujui :

Pembimbing Utama

(Ir. Hj. Lestari, MP )

NIP : 19580618 198403 2001

FAKULTAS PETERNAKAN

UNIVERSITAS MATARAM

MATARAM

2016

3




DARI LOMBOK TIMUR

OLEH

AHSANUL FAIZIN

B1D 010 031

INTISARI

Program Studi Peternakan Fakultas Peternakan Universitas Mataram

Jl. Majapahit No. 62 Matarm – NTB Tlp/Fax : (0370) 633603/640592

Email : [email protected]

Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragaman lokus protein

hemoglobin pada sample darah hasil persilangan ayam kampung kulit kuning dari

empat kabupaten di Pulau Lombok dengan pejantan dari Lombok Timur. Sampel

yang digunakan sebanyak 92 ekor: 24 ekor hasil persilangan induk Lombok Barat

dengan pejantan Lombok Timur; 21 ekor hasil persilangan induk Kota Mataram

dengan pejantan Lombok Timur; 19 ekor hasil persilangan induk Lombok Tengah

dengan pejantan Lombok Timur; 28 ekor hasil persilangan induk Lombok Timur

dengan pejantan Lombok Timur. Setiap ayam diambil darahnya sebanyak 1 ml.

Darah dipisahkan antara plasma dan hemolisat. Hemolisat di elektroforesis di

Laboratorium Imunobiologi Universitas Mataram untuk mendapatkan lokus

hemoglobin (Hb). ditemukan genotipe HbAD, HbBD dan HbCD dengan frekuensi

genotip (0,946),(0,011) dan (0,043), Pengaturan sistem perkawinan menggunakan

pejantan Lombok Timur dengan induk dari empat daerah, belum berpengaruh

terhadap keseimbangan H-W (P>0,05).

Kata Kunci : Keragaman, Lokus Hemoglobin, Persilangan, Ayam Kampung Kulit

Kuning.

mailto:[email protected]

4

DIVERSITY LOCUS HEMOGLOBIN OF CROSSING SKIN LOCAL

YELLOW CHICK CROSS WITH MALES FROM EAST lOMBOK

BY

AHSANUL FAIZIN

B1D 010 031

ABSTRACT

This study aims to determine the diversity of protein hemoglobin locus on a

blood sample of cross-breeding the yellow local hen from four districts of lombok

island to the rooster of east Lombok. It has been used about 92 chickens as the sample

24 chickens of crossbreding the hen of West Lombok,to the roosters of East Lombok;

21 chickens of crossbreeding the hen of mataram to the rooosters East Lombok; 19

chickens of crossbreeding the hen of Central Lombok to the roosters of Eas Lombok;

28 chickens of croosbreeding the hen of East Lombok to the roosters of East Lombok.

1 ml of the blood was taken from each of the chicken ( blood plasma was separated

from the hemolisate). We perform an electrophoresis test to diagnose and measure

hemoglobin (Hb) locus of hemolysate in imunobiology laboratory of Mataram

University. As a result. Genotypes that had been found were HbAD, HbBD and HbCD

with genotype frequency (0,946), (0,011) and (0,043). In sum, the croosing system of

the roosters from East Lombok to the hen of four district, had not affect the balance of

H-W.

Keywords : Diversity, Hemoglobin locus, Cross-breeding, yellow skin local hen.

.

5

PENDAHULUAN

Ayam kampung (Gallus domesticus) adalah salah satu jenis ternak unggas

yang merupakan turunan panjang dari proses sejarah perkembangan genetik

perunggasan ditanah air. Ayam kampung termasuk ayam bukan ras (buras) yang

merupakan jenis ayam yang cukup dikenal oleh masyarakat Indonesia yang tersebar

dan berkeliaran bebas diperumahan baik pedesaan maupun perkotaan.

Ayam kampung mempunyai peranan penting dalam pembagunan peternakan,

bahkan untuk menyongsong era globalisasi sekarang ini. Ayam kampung telah

mempunyai segmen pasar tersendiri. Ayam kampung mempunyai kelebihan pada

daya adaptasi tinggi karena mampu menyesuaikan diri dengan berbagai situasi,

kondisi lingkungan dan perubahan iklim serta cuaca setempat.

Ayam kampung memiliki fenotip yang bervariasi diantara variasi warna kulit.

Ayam kampung yang dipelihara di pedesaan yaitu memiliki warna kulit putih ,

kuning, hitam dan abu abu atau kehijauan ( Mansjoer et al, 1989 ). Menurut

Budiwati (1982) dan Rasyaf (1994) bahwa ayam kampung memiliki warna kulit

putih, kuning dan campuran. Sedangkan hasil penelitian Lestari (1998) hanya

menemukan dua macam warna kulit yaitu putih dan kuning pada ayam kampung.

Crawford (1990) menyatakan bahwa warna kulit kuning pada ayam ras

petelur disebabkan oleh tetuanya yang berkulit kuning dan makanan yang

mengandung xantophyl yang berasal dari makanan seperti jagung kuning atau alfalfa

yang menyebabkan warna kuning pada yolk telur, lemak tubuh, kulit, kaki, dan

paruh.

6

Warna kulit kuning disebabkan juga karena kelebihan Fe yang disimpan

dalam bentukferitin. Fe adalah prekursor Hb. Variasi warna kulit kuning di sebabkan

karena variasi lokus Hb.

Hemoglobin berfungsi untuk mengikat oksigen didalam darah. Hemoglobin

akan menjadi merah cerah jika mengandung banyak oksigen dan akan menjadi merah

gelap jika mengandung banyak karbondioksida. Hemoglobin dapat bergabung dengan

oksigen udara yang terdapat dalam paru-paru, sehingga terbentuklah oksihemoglobin

yang kemudian oksigen tersebut dilepaskan ke sel-sel jaringan tubuh.

Metode deteksi polimorfisme protein dengan teknik elektroforesis dapat

digunakan untuk mengetahui variasi genetik dalam populasi (Statio, 1997 ; Legates

dan Warwick, 1990 ).

Berdasarkan uraian diatas, maka perlu dilakukan penelitian tentang

keragaman lokus protein hemoglobin untuk mengetahui keragaman genotif dari gen

Na pada hemolisat darahayam kampung kulit kuning menggunakan pejantan Lombok

Timur.

7

MATERI DAN METODE PENELITIAN

Penelitian ini menggunakan sampel darah yang diambil dari 92 ekor ayam

kampung kulit kuning hasil persilangan induk dari 4 kabupaten yaitu Kota Mataram,

Lombok Barat, Lombok Tengah, Lombok Timur dengan menggunakan pejantan dari

Lombok Timur.

Bahan – bahan yang digunakan dalam penelitian ini yaitu : Acrylamide, Bis

acrylamide, Gliserol, TCA, Tris Amino Metan, Ponceau, Amonium persulfat, Asam

Asetat Glasial, TEMED, CBB,Glisin, dan aquabides.

Adapun alat yang digunakan dalam penelitian ini yaitu : Mikropipet berbagai

ukuran, Vortex, Shaker, Sentrifus, pH meter, dan Electroforesis.

Variabel yang diamati pada penelitian ini yaitu keragaman lokus Hb pada

sample darah ayam kampung.

Diawali dengan pengambilan sampel darah ayam kampung di Peternakan

Pagutan. Sampel darah diambil sebanyak 1 ml pada bagian vena sayap dengan

menggunakan alat suntik yang kemudian dimasukkan kedalam tabung EDTA.

Selanjutnya dibawa ke Laboratorium untuk dianalisa Elektroforesis.

Hasil penelitian ditabulasikan berdasarkan genotip dan alel lokus Hb hasil

elektroforesis hemolisat sample darah, kemudian dicari frekuensinya . frekuensi alel

dicari menggunakan rumus (Warwick et, al 1979).

𝑞A =∑ alel A

∑alel A + ∑ alel a

(1 − 𝑞)a =∑ alel A

∑alel A + ∑ alel a

8

Keterangan:

qA = Frekuensi alel A

(1-q)a = Frekuensi alel a

Untuk mengetahui dan menguji keseimbangan genetic diuji menggunakan uji X2

(Suryo, 1994), sbb :

X2 = 𝑑2

e

Keterangan :

X2

= Chi Square

∑ = Sigma (jumlah)

d = Deviasi/Penyimpangan yaitu selisih antara hasil yang

diproleh dengan hasil yg diharapkan

e = Hasil yang diramal/diharapkan

9

HASIL DAN PEMBAHASAN

Keragaman Genotip pada Protein Hemoglobin

Hasil analisis elektroforesis sampel hemolisat darah lokus Hb ayam kampung

kulit kuning hasil persilangan pejantan Lombok Timur dengan induk dari 4 daerah di

Pulau Lombok hanya ditemukan 3 macam genotip yaitu HbAD, HbBD HbCD dengan

frekuensi 0,946 0,011 0,043 masing-masing dapat dilihat pada Gambar 1.Lokus Hb

dikontrol oleh 4 macam alel. Pita tercepat disebut dengan alel A, diikuti dengan pita

dibelakangnya yaitu B, C dan D, sehingga kombinasi yang diharapkan yaitu AA, AB,

AC, AD, BB, BC, BD, CC, CD dan DD.

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12

Gambar 1. Contoh hasil elektroforesis hemolisat pada hasil persilangan

pejantan Lombok Timur.

Katoda (-)

Anode (+)

Hb D

Hb B

Hb C

Hb A

Sampel

10

Menurut Haris (1994), bahwa polimorfisme ditampilkan sebagai dua atau

lebih alel pada satu lokus. Polimorfisme terjadi karena adanya perbandingan asam

amino yang menyusun protein globin. Polimorfisme digunakan untuk menetapkan

suatu keadaan dimana populasi secara alami terdiri dari individu-individu yang

heterogen. Variasi genotip antar individu menghasilkan perbedaan distribusi

frekuensi gen pada suatu populasi (Leary dan Booke, 1990).

Tabel 1. Frekuensi genotipe dan alel sampel hemolisat darah ayam kampung kulit

kuning hasil persilangan menggunakan pejantan Lombok Timur.

Genotife Jumlah Frekuensi

Alel

A B C D

AB

0 0 0 0 0 0

AC 0 0 0 0 0 0

AD 87 0,946 0,473

0 0 0,473

BC 0 0 0

0 0 0

BD 1 0,011 0 0,005 0 0,005

CD 4 0,043 0 0 0,022 0,022

DD 0 0 0 0 0 0

JUMLAH 92 1 0,473 0,005 0,022 0,5

Jurnal Penelitian Fakultas Peternakan Universitas Mataram 2014

11

Hasil penelitian ini sedikit berbeda dengan hasil temuan Gunawan (2014)

yang menemukan 3 pita pada hasil persilangan dengan menggunakan pejantan

Lombok Barat dikontrol 3 alel yaitu A,B,C sedangkan lokus Hb hasil persilangan

menggunakan pejantan Lombok Timur ditemukan 4 alel yaitu A,B,C,dan D. Menurut

Suryo (1994) setiap 3 basa nitrogen disebut dengan kodon empat macam basa

nitrogen yaitu A,T,S,G diangggap sebagai alfabet mulekul DNA. Apabila terjadi

perubahan susunan kodon maka terjadinya perubahan kode asam amino sehingga

diduga perubahan jumlah pita lokus Hb disebabkan karena perubahan susunan basa

nitrogen. Terjadinya perubahan susunan basa nitrogen pada penelitian ini tidak

menyebabkan perubahan keseimbangan genetik sehingga Hb ayam kampung, yaitu

masih dalam keseimbangan alami atau tidak berbeda nyata (P>0,05)

Uji Keseimbangan Genetik

Hasil uji x2 (Chi Square) menunjukkan bahwa lokus Hb pada hasil persilangan

ayam kampung pejantan Lombok Timur dengan induk ayam kampung dari empat

daerah tidak ada pebedaan yang nyata atau masih dalam keseimbangan alami.

Menurut Noor (1996), Sulistyowati (1995), Warwick et al., (1990) dan Yatim (1980)

bahwa, dalam suatu populasi yang besar dimana terjadi perkawinan acak dan tidak

terjadi mutasi, migrasi, seleksi, genetic drift dan miotic drift, maka frekuensi gen dan

frekuensi genotipe dari generasi ke generasi adalah sama dan populasi berada dalam

keseimbangan alami.

Menurut Yatim (1980) bahwa, pengaruh genetic drift dapat diabaikan pada

populasi ternak besar, tetapi berpengaruh pada populasi ternak kecil. Pada populasi

yang kecil, perkawinan sekerabat dekat banyak berlangsung sehingga kemungkinan


12

jumlah ternak yang homozigot semakin meningkat, sedangkan heterozigot semakin

berkurang dari generasi kegenerasi.

Penggunaan pejantan Lombok Timur hasil penelitian Lestari (2000)

Mengatakan bahwa pejantan Lombok Timur memiliki hubungan kekerabatan terjauh

dibandingkan dengan ayam dari daerah lain, sehingga diharapkan terjadi perubahan

frekuensi genotipe.

Hasil penelitian Lestari dkk (2000) bahwa pejantan Lombok Barat memiliki

hubungan kekerabatan terjauh dibandingkan dengan ayam dari daerah lain.Perubahan

pengaturan sistem perkawinan menggunakan pejantan dari Lombok Timur tidak

merubah keseimbangan genotipe lokus pada Hb.

KESIMPULAN DAN SARAN

Kesimpulan

1. Hasil persilangan Pejantan Lombok Timur dengan induk dari empat

kabupaten di Pulau Lombok ditemukan genotip adalah HbAD,HbBD, dan

HbCD sehingga dikontrol oleh alel A, B, C dan D.

2. Hasil persilangan menunjukkan masih dalam keseimbangan H-W (P>0,05).

Saran

Untuk merubah keseimbangan H-W silangkan ayam yang memiliki hubungan

kekerabatan jauh seperti ayam kampung dengan ayam ras.


13

DAFTAR PUSTAKA

Aman, Y, 2011. Ayam Kampung Unggul. Penerbit Penebar Swadaya. Jakarta.

Anonimus, 2008. Anemia Defisiensi Besi.http//cafepojok. Com/ forum/archive/

index.Php/1-3118.html

Bakrie and Manwell. 1986. Population Genetics, Molecular Marker and Gene

Conservation of Bovine Breeds.In : Neimann and Hickman (Ed).

WorldAnimal Science. Elsevier Healt Sciences. London.

Budiwati, T. 1982. Beberapa Sifat Kuantitatif Ayam Sebagai Dasar Pertimbangan

Seleksi. Poult Ind. 46.

Crawford. R.D. 1990. Original and History of Poultrey Species. R.D Crawford (ed).

Poultrey Breeding and Geneties.Elseveir Science Publishing company inc.

Canada.

Frandson, R. D. 1992. Anatomi dan Fisiologi Ternak. Gajah Mada Uneversity Press,

Yogyakarta.

Ganong, W. F. 1995. Review of Medical Physiology.17th ed. Lange Medical

Publiscations, California.

Gunawan R.A. 2014. Studi Keragaman Lokus Hemoglobin Hasil Persilangan (F1)

Ayam Kampung kulit kuning di Pulau Lombok dengan pejantan dari Lombok

Barat. .(Skripsi)Fakultas Peternakan. Universitas Mataram.

Harper, H. A., V. W. Rodwell, dan P. A. Mays. 1984. Biochemistry. Large Medical

Publication Drawer L., Los Altas. California.

Harris, H. 1994. Dasar-Dasar Biokimia Manusia. Universitas Gadjah Mada.

Yogyakarta.

Leary, R. F. and H. E. Booke. 1990. Starch Gel Elektroforesis and Species

Distinection. Am. Fish. Soc. Bethesda, Maryland, USA. Pp. 141-170.

Legates, J. E and Warwick. 1990. Breeding and Improvement of Farm Animals. 8th

Edition. McGraw-Hill Publising Company, New York.

Lestari. 1998. Pengkajian Kekerabatan Ayam Kampung dan Ayam Ras Berdasarkan

Analisis Elektroforesis Protein Darah. Thesis. Program Pasca Sarjana

Universitas Gadjah Mada. Yogyakarta.


14

Lestari dan J. Rahma, 1999. Estimasi Jarak Genetik Antar Populasi Ayam Kampung

Di Pulau Lombok Berdasarkan Polimorfisme Protein Darah. Laporan

Penelitian. Fakultas Peternakan. Universitas Mataram. Mataram.

Lestari. 2000. Polimorfisme Protein Plasma Darah Ayam Kampung DenganTeknik

PAGE Pada Konsentrasi Akrilamid Berbeda.Laporan Penelitian. Fakultas

Peternakan. Universitas Mataram. Mataram.

Lestari, S. Prasetyo dan N. K. D. Haryani. 2013. Mengangkat Potensi Genetik dan

Produktivitas Ayam Kampung yang Memiliki Gen Na Di Pulau Lombok.

Laporan Penelitian. Fakultas Peternakan. Universitas Mataram. Mataram.

Mansjoer, SS, 1989. Pengembangan ayam lokal di Indonesia. Prosiding Seminar

Peran Unggas Lokal di Indonesia, Lustrum V. Fakultas Peternakan,

Universitas Diponegoro, Semarang.

Mansjoer, I.,S.S. Mansjoer dan D. Sayuthi.1989. Studi Banding Sifat-sifat Biologis

Ayam Kampung, Ayam Pelung Dan Ayam Bangkok. Buletin Penelitian IPB.

7 (I) :77-86.

Noor, R. R. 2000. Genetika Ternak. Penebar Swadaya. Jakarta.

Nurfilaliyati. 2013. Studi Keragaman Lokus Protein Hemoglobin Pada Hemolisat

Darah Ayam Kampung berkulit Kuning. Di Pulau Lombok. Fakultas

Peternakan. (Skripsi) Universitas Mataram.

Ogita, Z. I. & Markert. 1979. A Miniaturized System for Electrophoresis on

Polyacrilamide Gels. Anal.Biochem. 99: 233-241.

Rasyaf, M. 1994. Beternak Ayam Kampung. Penerbit Penebar Swadaya. Jakarta.

Stansfield, W. D. dan S. L. Elrod. 2002. Genetika. Edisi ke-4. Terjemahan: Damaring

Tyas W. Erlangga, Jakarta.

Statio, D. L. 1997. Biochemical Genetics Sheep. Edited by Piper L. and Ruvisky A.,

Cab Internationals, Oxon.

Stenesh, J. 1983. Immunochemistry, Precipitin Curve and Immunodiffusin. Exp.

Bio..39 : 491-501.

Sulistyowati, D.I. 1994. Genetika Populasi Fakultas Perikanan. Institut Tekhnologi

Bandung. Bandung.

Suryo. 1994. Genetika. Universitas Gadjah Mada, Uninversity PressYogyakarta.

Tjahjaningsih, D. P. 1991. Studi Karakteristik Fenotipe Ayam Kampung, Ayam

Pelung, dan Ayam Bangkok dan Keturunan Pertamanya (F2) Melalui


15

Polimorfisme Protein Darah.Skripsi. Fakultas Peternakan, Institut Pertanian

Bogor, Bogor.

Warwick, E. J. and J. E. Legates. 1979. Breeding and Improvement of Farm Animals.

McGrawh Hill Book Compan, New York, USA.

Warwick, E. J., J. M. Astuti dan W. Hardjosoebroto.1990. Pemuliaan Ternak. Edisi

ke-4. Gadjah Mada University Press, Yogyakarta.

KERAGAMAN LOKUS HEMOGLOBIN ( Hb) PADA AYAM …eprints.unram.ac.id/6833/1/JOURNAL.pdfAyam kampung (Gallus domesticus) adalah salah satu jenis ternak unggas yang merupakan turunan panjang

Documents