7/23/2019 1. Pengantar Sismik
1/20
SISTEMATIKA MIKROBA
7/23/2019 1. Pengantar Sismik
2/20
QUIZ 2 (15 MENIT)
1. Jelaskan tentang p!ses pe"#ent$kan #%!&%l"'
2. Jelaskan tentang n%la% pent%ng as!s%as% "%k!%a#ag% p!$ks% petan%an'
7/23/2019 1. Pengantar Sismik
3/20
PENGANTAR SISTEMATIKA MIKROBIA
Sistematika: %l"$ *ang "e"pela+a% keanekaaga"an "a,l$k
,%$p seta ,$#$ngan kekea#atan anta sesa"an*a
Tiga bidang kajian sistematika:
Klas%&%kas%
Tatana"a (N!"enklat$)
Ient%&%kas%
7/23/2019 1. Pengantar Sismik
4/20
Taksonomi- %l"$ *ang "e"pela+a% te!% klas%&%kas% *ang "enak$p asa/
p%ns%p seta at$an klas%&%kas%
Klasifikasi - paktek taks!n!"% *a%t$ p!ses penataan !gan%s"e ke ala"
s$at$ kel!"p!k (taks!n) #easakan ,$#$ngan ke"%%pan
(s%"%la%tas) ata$ ,$#$ngan kekea#atan (e0!l$s%!ne).
Identifikasi- p!ses an ,as%l penent$an apaka, s$at$ !gan%s"e *ang
#el$" %kenal "e$pakan angg!ta kel!"p!k *ang s$a,
%keta,$% se#el$"n*a ata$ #$kan.
Tatanama: aa pe"#e%an na"a %l"%a, "a,l$k ,%$p "en$$t k!e
tatana"a.
7/23/2019 1. Pengantar Sismik
5/20
SEJARA K!ASI"IKASI MA!#K I$#P-
asa Klas%&%kas%
A%st!teles ( "% 1344san) - $n%a lantae6 Kena"pakan "!&!l!g% l$a
$n%a An%"al%a
E. 7aekel (1388) - $n%a lantae6 "!&!l!g% ("%k!sk!p%s) an &%s%!l!g%
$n%a An%"al%a6
$n%a !t%sta
E. 9,att!n (1:;,%ttake (1:8:)- $n%a M!nea !gan%sas% %ntenal sel6 n$t%s%/ $n%a !t%sta st$kt$ !gan%sas% sel$la
$n%a ?$ng%
$n%a lantae
$n%a An%"al%a
7/23/2019 1. Pengantar Sismik
6/20
9al >!ese (1:
7/23/2019 1. Pengantar Sismik
7/20
SISTEM K!ASI"IKASI
"enetik: #easakan ke"%%pan s%&at
"ilogenetik: #easakan ,$#$ngan e0!l$s%
7/23/2019 1. Pengantar Sismik
8/20
$ASAR %PEN$EKATAN& SISTEM
K!ASI"IKASI:
Klasifikasi klasik monotetik
Klasifikasi numerik-fenetik-politetik
Klasifikasi kimiawi (khemotaksonomi)
Klasifikasi molekular (taksonomi molekular)
Taksonomi polifasik
7/23/2019 1. Pengantar Sismik
9/20
K!ASI"IKASI $AN IERARKI TAKSONOMIS:
Hierarki TaksonomisHierarki Taksonomis
Dom ainDom ain EukaryaEukarya BakteriaBakteria ArkhaeaArkhaea
DuniaDunia PlantaePlantae BakteriaBakteria ArkhaeaArkhaea
PhylumPhylum AnthophytaAnthophyta ProteobacteriaProteobacteria CrenarcheotaCrenarcheota
ClassisClassis MonocotyledoneaeMonocotyledoneae Gamma ProteobacteriaGamma Proteobacteria ThermoproteiThermoprotei
OrdoOrdo CommelinalesCommelinales EnterobacterialesEnterobacteriales SulfolobalesSulfolobales
FamiliaFamilia PoaceaePoaceae EnterobacteriaceaeEnterobacteriaceae SulfolobaceaeSulfolobaceae
GenusGenus ZeaZea SalmonellaSalmonella SulfolobusSulfolobus
SpeciesSpecies Zea maysZea mays S. dysenteriaeS. dysenteriae Slf. MetallicusSlf. Metallicus
7/23/2019 1. Pengantar Sismik
10/20
TATANAMA %NOMENK!AT#R&
International Code of Bacterial omenclature(Sneat,/ 1::2).
International Code of Botanical omenclature(@e$te et al./ 1::)
International Code of !oological omenclature(R%e et al./ 1:35)
Sistem binomial- nama spesies terdiri dari dua kata
Bahasa "atin atau diperlakukan se#agai #ahasa "atin
Na"a gen$s - diawali dengan huruf kapital e$g$ Bacillus
en$n+$k spes%es - ditulis dengan huruf kecil e$g$ su#tilis Na"a spes%es - Bacillus subtilis
7/23/2019 1. Pengantar Sismik
11/20
KONSEP SPESIES:
omenspecies- s,ae t,e sa"e t%pe strain
Ta&ospecies - s%"%la%t* %ne
7/23/2019 1. Pengantar Sismik
12/20
MI'ROBIA! S(STEMATI'S- MI9ROBIAD
IERSITF = REDATIONS7I
9lass%&%ass%!n- N!"enlat$e-
Ient%&%at%!n-
7/23/2019 1. Pengantar Sismik
13/20
9DASSI?I9ATION
'lassifi)ation- p!ess = p!$t
Ta*onom+- t,e!%t%al st$* !&
lass%&%at%!n
At%&%%al lass%&%at%!n -spe%al p$p!se
,enet% lasss%&%at%!n-
,*l!genet% (p,*let%) lass%&%at%!n-
7/23/2019 1. Pengantar Sismik
14/20
NOMEN9DATURE
Ba)te,ia - A,).aea-
International Code of omenclature for Bacterial
App!0e D%st !& Bate%al Na"e 1 Jan$a* 1:34.
al% p$#l%at%!n (IJSB IJSEM (2444) T*pe sta%n "$st #e es%gnate
"/ngi - Algae-
International Code of Botanical omenclatureP,oto0oa:
International Code of !oological omenclature -
7/23/2019 1. Pengantar Sismik
15/20
MOERN SFSTEMATI9S
Identifi)ation- "%!#%al e!l!g*/ %n$st%al
#%!te,n!l!g*/ %agn!st%
,!sp%tal "%!#%!l!g*
'/,,ent t,ends- M!en "%!#%als*ste"at%s
9,e"%st*- chemos%stematics
M!le$la #%!l!g*- molecular s%stematics
ata ,anl%ng- numerical phenetic
s%stematics
7/23/2019 1. Pengantar Sismik
16/20
'EMOTA1ONOM(
'.emota*onom+- amino acids lipids pol%sacharides proteins
en%mes whole-cell
@9
7D9
*MS (*!l*s%s Mass Spet!"et*)
Elet!p,!es%s
7/23/2019 1. Pengantar Sismik
17/20
N#MERI'A! PENETI' TA1ONOM(
N/me,i)al 2.eneti) ta*onom+- p,en!t*p% test =!"p$te anal*s%s
'/lt/,al- colonial morpholog% pigmentation
Mo,2.ologi)al- cell shape staining reaction motilit%
P.+siologi)al- growth temp$ anaero#ic growth
Bio).emi)al- acid from car#oh%drates nitrate reduction
N/t,itional- car#on sources
'.emota*onomi)- amino acids cell wall mem#rane lipids
In.ibito,+ tests- sensiti*it% to anti#iotics
Se,ologi)al- agglutination
Genomi)- mol + 'C ,-, reassociation
7/23/2019 1. Pengantar Sismik
18/20
PO!(PASI' S(STEMATI'S
Pol+2.asi) s+stemati)s- integrated use of genot%picand
phenot%pic data
9!ng$ene- chemota&onomic numerical phenetic and
molecular s%stematics
7/23/2019 1. Pengantar Sismik
19/20
?IE KIN@OM = T7REE OMAIN
7/23/2019 1. Pengantar Sismik
20/20
TREE O? DI?E- T7REE OMAIN